En caso de haber tenido un problema con el avión durante un viaje de negocios, en el que la empresa ha pagado mi billete, ¿quién tiene que hacer la petición de indemnización? ¿Quién la cobrará?

Usted. El pasajero es el encargado de hacer la petición de reclamación (formulario online) y es el que recibirá, si procede, la indemnización prevista.
Según el Reglamento Europeo, en este caso, se protege a las personas físicas, reparando los daños sufridos como la espera, fatiga, estrés, etc.
Esta indemnización no sustituye el recurso disponible, dirigido a la empresa pagadora del billete. El reembolso del billete, es un reembolso totalmente distinto a la indemnización prevista para el viajero, y deberá ser reclamado a la agencia de viajes.